Università degli studi di Pavia
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Savino curriculum
Curriculum
Dati personali
Data di nascita: 6 Dicembre 1990
Luogo di nascita: Pavia
Nazionalità: Italiana
Indirizzo: via Maestra 115 Borgo San Siro (PV)
Cellulare: 3397672756
Email: simone.savino01@universitadipavia.it
Istruzione
2014-oggi
-PhD student in Genetica, Biologia Molecolare e Cellulare
Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “L. SPALLANZANI” Università di Pavia, Italia
Specializzazione: Biologia Strutturale, Biocristallografia, Glicobiologia e Glicochimica
Linea di ricerca: Struttura e funzione di glicoenzimi
2012-2014
-Laurea specialistica: Molecular Biology and Genetics (101/110)
Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “L. SPALLANZANI” Università di Pavia, Italia
Specializzazione: Biologia Strutturale e Biocristallografia
Titolo della tesi: Elucidating the three-dimensional structure of a novel fungal Baeyer-Villiger monooxygenase
2009-2012
-Laurea triennale: Biotecnologie Biomolecolari (93/110)
Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “L. SPALLANZANI” Università di Pavia, Italia
Titolo della tesi: Utilizzo di saggi ELISA per la misura dell’affinità tra proteine (Kd)
2004-2009
-Diploma di scuola superiore (74/100)
LICEO CLASSICO “B. CAIROLI” VIGEVANO (PV), ITALY
Esperienze di ricerca
2014-oggi
-PhD student nel laboratorio di Biocristallografia di Andrea Mattevi, Università di Pavia
Nei miei primi due mesi come PhD student ho portato avanti un mio progetto circa la caratterizzazione strutturale di una idrossisteroide deidrogenasi di interesse farmacologico.
2012-2014
-Studente nel laboratorio di Biocristallografia di Andrea Mattevi, Università di Pavia
La mia esperienza si è focalizzata sull’ottenimento di cristalli di proteina e sulla successive caratterizzazione strutturale di diverse marcomolecole. Il progetto principale richiedeva conoscenze in flavoenzimologia. Nonostante ciò ho anche acquisito conoscenze in biologia molecolare, colture cellulari, espressione e purificazione di proteine e saggi biochimici. Durante il mio internato ho avuto modo di risolvere le strutture di due proteine non correlate tra loro.
2014
-Studente nel laboratorio “Armenise-Harvard” di Federico Forneris, Università di Pavia
Durante la mia esperienza ho condotto test di cristallizzazione, espressione di protein e purificazioni analitiche. Ho avuto modo in questo periodo di risolvere la struttura di una porzione di un’altra proteina.
Tecniche acquisite
Padronanza delle seguenti tecniche di laboratorio:
- Espressione proteica in E. coli e P. pastoris
- Purificazione proteica con sistema per cromatografia AKTA (affinità, size exclusion e desalting)
- Tecniche elettroforetiche
- Spettroscopia in assorbanza e fluorescenza
- Tecniche di biologia molecolare
- Cristallizzazione di proteine (vapour diffusion, microbatch, manuale e robotizzata)
- Colture batteriche
- PCR
- Trasformazione di DNA plasmidico per heat shock ed elettroporazione - Plasmidic DNA extraction
- SDS-PAGE
- Saggi d’attività enzimatica
Abilità informatiche generiche e di biologia strutturale:
- Padronanza dei sistemi operativi: Microsoft Windows, Apple Macintosh and varianti di Linux
- Padronanza dei pacchetti Microsoft Office e Apple iWork
- Programmi di biologia strutturale: iMosflm, ccp4i suite, Phenix, Coot, PyMOL, ccp4mg
- Database e strumenti NCBI
- Database e strumenti EMBL-EBI
Corsi, seminari ed altre esperienze
Frontiers in structural biology, Milano, 24-25 Novembre 2014
1st European crystallography school, Pavia, 28 Agosto - 6 Settembre 2014
Short course in NMR spectroscopy in molecular and structural biology by Prof. Annalisa Pastore, Pavia, 5-7 Maggio 2014
Short course in Structural biology and pharmacology by Prof. Dale Edmondson, Pavia, 14-15 Aprile 2014
EPIGEN-MiChroNetwork Chromatin Seminar, Pavia, 21 Gennaio 2014
Short course in Plant molecular biology and biotechnology by Dr. Silvia Costa, Pavia 14-16 Gennaio 2014
Short course in Chromosome structure and dynamics by Prof. Kevin Sullivan, Pavia, 3-5 Dicembre 2013
Competenze personali e lingue straniere
Estremamente motivato nel portare avanti i miei progetti ma altrettanto interessato nell’essere coinvolto in quelli altrui. Nonostante il mio principale interesse sia la biologia strutturale, sarei lieto di ampliare le mie conoscenze attraverso collaborazioni riguardanti esclusivamente la biologia molecolare. Tra i miei interessi in campo scientifico vi è l’acquisizione di tecniche di biologia strutturale diverse dalla biocristallografia ed il rafforzamento delle competenze nella pura cristallografia. Lavoro bene in gruppo ed in condizioni di stress, cercando di contribuire come posso sia dal punto di vista pratico che nell’organizzazione e gestione di spazi, tempo ed altre risorse. In grado di lavorare con personale straniero, anche adoperandomi nell’accomodamento.
Lingue straniere: - Inglese: buon livello sia nel campo scientifico che nell’uso quotidiano
- Francese: livello base
Pubblicazioni e comunicazioni a congressi
Progetto di ricerca
Struttura e funzione di glicoenzimi
Grazie ad una collaborazione tra ACIB (Centro austriaco per la biotecnologia industriale) ed il gruppo di Biologia Strutturale di Pavia, il mio progetto sarà focalizzato sulla caratterizzazione strutturale di due diverse proteine bersaglio coinvolte nei processi di glicosilazione. L'idea da cui nasce tale collaborazione è principalmente rivolta allo sviluppo di tecniche di chimica verde, con la prospettiva di degradare sottoprodotti provenienti dalla produzione industriale di prodotti chimici.
Per raggiungere l'obiettivo finale, il mio lavoro partirà dall’espressione delle proteine e dalla loro purificazione. Una volta che le proteine saranno disponibili in discreta quantità, procederò con la caratterizzazione biofisica, con lo scopo di trovare le migliori condizioni. In condizioni ideali, la purezza del campione aumenterà al livello richiesto per la cristallizzazione di proteine e tecniche cristallografiche saranno infine applicate per ottenere la struttura macromolecolare.
A seconda dei risultati prodotti da questa prima fase, ulteriori indagini saranno programmate, come studi biochimici e di mutagenesi, al fine di migliorare l'attività enzimatica in una prospettiva di selettività del prodotto.
Dati personali
Data di nascita: 6 Dicembre 1990
Luogo di nascita: Pavia
Nazionalità: Italiana
Indirizzo: via Maestra 115 Borgo San Siro (PV)
Cellulare: 3397672756
Email: simone.savino01@universitadipavia.it
Istruzione
2014-oggi
-PhD student in Genetica, Biologia Molecolare e Cellulare
Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “L. SPALLANZANI” Università di Pavia, Italia
Specializzazione: Biologia Strutturale, Biocristallografia, Glicobiologia e Glicochimica
Linea di ricerca: Struttura e funzione di glicoenzimi
2012-2014
-Laurea specialistica: Molecular Biology and Genetics (101/110)
Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “L. SPALLANZANI” Università di Pavia, Italia
Specializzazione: Biologia Strutturale e Biocristallografia
Titolo della tesi: Elucidating the three-dimensional structure of a novel fungal Baeyer-Villiger monooxygenase
2009-2012
-Laurea triennale: Biotecnologie Biomolecolari (93/110)
Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “L. SPALLANZANI” Università di Pavia, Italia
Titolo della tesi: Utilizzo di saggi ELISA per la misura dell’affinità tra proteine (Kd)
2004-2009
-Diploma di scuola superiore (74/100)
LICEO CLASSICO “B. CAIROLI” VIGEVANO (PV), ITALY
Esperienze di ricerca
2014-oggi
-PhD student nel laboratorio di Biocristallografia di Andrea Mattevi, Università di Pavia
Nei miei primi due mesi come PhD student ho portato avanti un mio progetto circa la caratterizzazione strutturale di una idrossisteroide deidrogenasi di interesse farmacologico.
2012-2014
-Studente nel laboratorio di Biocristallografia di Andrea Mattevi, Università di Pavia
La mia esperienza si è focalizzata sull’ottenimento di cristalli di proteina e sulla successive caratterizzazione strutturale di diverse marcomolecole. Il progetto principale richiedeva conoscenze in flavoenzimologia. Nonostante ciò ho anche acquisito conoscenze in biologia molecolare, colture cellulari, espressione e purificazione di proteine e saggi biochimici. Durante il mio internato ho avuto modo di risolvere le strutture di due proteine non correlate tra loro.
2014
-Studente nel laboratorio “Armenise-Harvard” di Federico Forneris, Università di Pavia
Durante la mia esperienza ho condotto test di cristallizzazione, espressione di protein e purificazioni analitiche. Ho avuto modo in questo periodo di risolvere la struttura di una porzione di un’altra proteina.
Tecniche acquisite
Padronanza delle seguenti tecniche di laboratorio:
- Espressione proteica in E. coli e P. pastoris
- Purificazione proteica con sistema per cromatografia AKTA (affinità, size exclusion e desalting)
- Tecniche elettroforetiche
- Spettroscopia in assorbanza e fluorescenza
- Tecniche di biologia molecolare
- Cristallizzazione di proteine (vapour diffusion, microbatch, manuale e robotizzata)
- Colture batteriche
- PCR
- Trasformazione di DNA plasmidico per heat shock ed elettroporazione - Plasmidic DNA extraction
- SDS-PAGE
- Saggi d’attività enzimatica
Abilità informatiche generiche e di biologia strutturale:
- Padronanza dei sistemi operativi: Microsoft Windows, Apple Macintosh and varianti di Linux
- Padronanza dei pacchetti Microsoft Office e Apple iWork
- Programmi di biologia strutturale: iMosflm, ccp4i suite, Phenix, Coot, PyMOL, ccp4mg
- Database e strumenti NCBI
- Database e strumenti EMBL-EBI
Corsi, seminari ed altre esperienze
Frontiers in structural biology, Milano, 24-25 Novembre 2014
1st European crystallography school, Pavia, 28 Agosto - 6 Settembre 2014
Short course in NMR spectroscopy in molecular and structural biology by Prof. Annalisa Pastore, Pavia, 5-7 Maggio 2014
Short course in Structural biology and pharmacology by Prof. Dale Edmondson, Pavia, 14-15 Aprile 2014
EPIGEN-MiChroNetwork Chromatin Seminar, Pavia, 21 Gennaio 2014
Short course in Plant molecular biology and biotechnology by Dr. Silvia Costa, Pavia 14-16 Gennaio 2014
Short course in Chromosome structure and dynamics by Prof. Kevin Sullivan, Pavia, 3-5 Dicembre 2013
Competenze personali e lingue straniere
Estremamente motivato nel portare avanti i miei progetti ma altrettanto interessato nell’essere coinvolto in quelli altrui. Nonostante il mio principale interesse sia la biologia strutturale, sarei lieto di ampliare le mie conoscenze attraverso collaborazioni riguardanti esclusivamente la biologia molecolare. Tra i miei interessi in campo scientifico vi è l’acquisizione di tecniche di biologia strutturale diverse dalla biocristallografia ed il rafforzamento delle competenze nella pura cristallografia. Lavoro bene in gruppo ed in condizioni di stress, cercando di contribuire come posso sia dal punto di vista pratico che nell’organizzazione e gestione di spazi, tempo ed altre risorse. In grado di lavorare con personale straniero, anche adoperandomi nell’accomodamento.
Lingue straniere: - Inglese: buon livello sia nel campo scientifico che nell’uso quotidiano
- Francese: livello base
Pubblicazioni e comunicazioni a congressi
Progetto di ricerca
Struttura e funzione di glicoenzimi
Grazie ad una collaborazione tra ACIB (Centro austriaco per la biotecnologia industriale) ed il gruppo di Biologia Strutturale di Pavia, il mio progetto sarà focalizzato sulla caratterizzazione strutturale di due diverse proteine bersaglio coinvolte nei processi di glicosilazione. L'idea da cui nasce tale collaborazione è principalmente rivolta allo sviluppo di tecniche di chimica verde, con la prospettiva di degradare sottoprodotti provenienti dalla produzione industriale di prodotti chimici.
Per raggiungere l'obiettivo finale, il mio lavoro partirà dall’espressione delle proteine e dalla loro purificazione. Una volta che le proteine saranno disponibili in discreta quantità, procederò con la caratterizzazione biofisica, con lo scopo di trovare le migliori condizioni. In condizioni ideali, la purezza del campione aumenterà al livello richiesto per la cristallizzazione di proteine e tecniche cristallografiche saranno infine applicate per ottenere la struttura macromolecolare.
A seconda dei risultati prodotti da questa prima fase, ulteriori indagini saranno programmate, come studi biochimici e di mutagenesi, al fine di migliorare l'attività enzimatica in una prospettiva di selettività del prodotto.
