Università degli studi di Pavia
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Falchetto attività di ricerca
Studio dei Microsatelliti
Il lavoro svolto durante il mio primo anno di dottorato si è focalizzato sullo studio di popolazioni di Glossina pallidipes catturate in diverse aree del Kenya. Per migliorare l’efficacia dei programmi di controllo ed eradicazione di questa specie infestante, risulta necessario conoscere la dinamica di popolazione ed il comportamento riproduttivo della specie. Per la genotipizzazione di individui maschi e femmine sono stati utilizzati i microsatelliti (Single Sequence Repeats, SSRs loci), marcatori polimorfici che permettono di disegnare un profilo delle popolazioni in esame:
- mediante il genotyping del DNA proveniente dalle zampe di femmine e maschi di 3 diverse popolazioni è possibile identificare i polimorfismi a livello di lunghezza dei microsatelliti e definire la dinamica e struttura di queste popolazioni;
- mediante il genotyping del DNA degli spermi derivati dalle spermateche delle femmine si può sottostimare il numero di volte che una femmina si accoppia in natura (remating) per spiegare come il comportamento sessuale può influenzare la stabilità e le dimensioni delle popolazioni.
Studio degli endosimbionti
Per verificare la presenza e le relazioni simbiontiche che instaurano Wolbachia (Rickettsiae) e Sodalis con l’insetto ospite, è stata effettuata un’analisi su individui di G. pallidipes e G. morsitans catturate in Kenya:
- screening di PCR attraverso l’utilizzo di sequenze proprie degli endosimbionti;
- FISH (Fluorescent In Situ Hybridisation) sui cromosomi mitotici di Glossina morsitans morsitans al fine di investigare il trasferimento orizzontale di sequenze di Wolbachia nel genoma di Glossina.
Glossina genome Annotation
Il lavoro svolto durante il mio primo anno di dottorato si è focalizzato sullo studio di popolazioni di Glossina pallidipes catturate in diverse aree del Kenya. Per migliorare l’efficacia dei programmi di controllo ed eradicazione di questa specie infestante, risulta necessario conoscere la dinamica di popolazione ed il comportamento riproduttivo della specie. Per la genotipizzazione di individui maschi e femmine sono stati utilizzati i microsatelliti (Single Sequence Repeats, SSRs loci), marcatori polimorfici che permettono di disegnare un profilo delle popolazioni in esame:
- mediante il genotyping del DNA proveniente dalle zampe di femmine e maschi di 3 diverse popolazioni è possibile identificare i polimorfismi a livello di lunghezza dei microsatelliti e definire la dinamica e struttura di queste popolazioni;
- mediante il genotyping del DNA degli spermi derivati dalle spermateche delle femmine si può sottostimare il numero di volte che una femmina si accoppia in natura (remating) per spiegare come il comportamento sessuale può influenzare la stabilità e le dimensioni delle popolazioni.
Studio degli endosimbionti
Per verificare la presenza e le relazioni simbiontiche che instaurano Wolbachia (Rickettsiae) e Sodalis con l’insetto ospite, è stata effettuata un’analisi su individui di G. pallidipes e G. morsitans catturate in Kenya:
- screening di PCR attraverso l’utilizzo di sequenze proprie degli endosimbionti;
- FISH (Fluorescent In Situ Hybridisation) sui cromosomi mitotici di Glossina morsitans morsitans al fine di investigare il trasferimento orizzontale di sequenze di Wolbachia nel genoma di Glossina.
Glossina genome Annotation
