Universitą degli studi di Pavia
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Brandini curriculum
Curriculum
INFORMAZIONI PERSONALI
Cognome e nome: Brandini Stefania
Data e luogo di nascita: 11 maggio 1988, Bari (BA)
E mail: stefania.brandini01@universitadipavia.it
Skype: stefania.brandini1
ISTRUZIONE E FORMAZIONE
- Novembre 2013 ad oggi
Dottorato di ricerca in Genetica, Biologia Molecolare e Cellulare presso l’Universitą degli Studi di Pavia, Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “Lazzaro Spallanzani”, laboratorio di Genetica Umana, supervisore prof. A Torroni
- Ottobre 2010 - Marzo 2013
Laurea magistrale in Biologia Cellulare e Molecolare, indirizzo genomico con votazione 110/110 e lode presso Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”
Discussione della tesi sperimentale in Immunogenetica dal titolo “Organizzazine genomica, analisi di espressione ed evoluzione dei loci del T cell receptor gamma (TRG) e beta (TRB) in Tursiops truncatus”, relatori prof.sse R. Antonacci, S. Ciccarese
- Ottobre 2006 - Luglio 2010
Laurea triennale in Biologia Cellulare e Molecolare con votazione 106/110 presso Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”
Discussione della tesi sperimentale in Biologia Molecolare dal titolo “Studio dell’espressione dei geni DRD1, DRD2 e DARPP32 attraverso Real Time PCR”, relatore prof.ssa G. Gadaleta
- Settembre 2001 - Luglio 2006
Maturitą scientifica presso Liceo Scientifico “E. Fermi”, Bari
ESPERIENZA PROFESSIONALE
- Ottobre 2014 ad oggi
Tutor didattico nel corso di Genetica I, corso di laurea in Biologia, Universitą degli Studi di Pavia, supervisore prof.ssa O. Semino
- Settembre 2013 - Ottobre 2013
Insegnante al Corso di recupero “Statistica applicata alle biotecnologie, integrato con genetica”, Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”, Dipartimento di Bioscienze, Biotecnologie e Biofarmaceutica
- Aprile 2013 - Ottobre 2013
Tirocinio post-laurea presso il laboratorio di Immunogenetica, Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”, Dipartimento di Biologia, prof.ssa S. Ciccarese
- Marzo 2012 - Marzo 2013
Internato presso il laboratorio di Immunogenetca presso Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”, Dipartimento di Biologia, prof.sse R. Antonacci, S. Ciccarese
- Agosto 2011 - Marzo 2012
Attivitą volontaria presso il laboratorio di colture primarie e metastatizzazione, I.R.C.C.S. Ospedale Oncologico di Bari, Istututo Tumori “Giovanni Paolo II”, dott.ssa A. Bellizzi
- Gennaio 2010 - Marzo 2010
Tirocinio presso il laboratorio di Biologia Molecolare presso Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”, Dipartimento di Biologia, prof.ssa G. Gadaleta
QUALIFICHE PROFESSIONALI
- Settembre 2013
Abilitazione alla professione di biologo, presso Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”
PARTECIPAZIONE A CORSI E CONVEGNI
- Settembre 2015
Joint Meeting AGI-SIMA, Cortona, 28-30 September 2015
- Settembre 2014
FISV XIII Congress – FISV 2014, Pisa, Italy, 24-27 September 2014
- Settembre 2014
CABGen Bioinformatics course
- Agosto 2013 - Settembre 2013
10th IVIS MILAN 2013 28th August- 1st September International Veterinary Immunology Symposium
- Ottobre 2010
Corso di formazione “Stato dell’arte e nuovi approcci biomolecolari in oncologia: dalla ricerca al laboratorio”, I.R.C.C.S. Ospedale Oncologico di Bari, Istituto Tumori “Giovanni Paolo II”
COMPETENZE TECNICHE
- Analisi di espressione genica mediante 3’RACE, 5’RACE, RT-PCR, Real Time PCR
- Estrazione di DNA ed RNA da sangue, tessuti e saliva
- Dosaggio genico
- Clonaggio mediante trasformazione per shock termico
- Estrazione e purificazione di DNA plasmidico
- Digestioni enzimatiche, RFLP
- PCR su DNA genomico e mitocondriale
- Preparazione di librerie NGS
- Analisi di sequenze ottenute tramite sequenziamento Sanger e Illumina
- Analisi filogenetiche
- Test di paternitą mediante analisi di microsatelliti
- Processazione di tessuti e colture primarie
- Immunofluorescenza
CONOSCENZE INFORMATICHE
- Ambiente Windows e OS X
- Banche dati biologiche (NCBI, Ensemble)
- Programmi per analisi di sequenza, costruzione di primer e di alberi filogenetici, analisi statistiche
LINGUE
- Madrelingua: Italiano
- Seconda lingua: Inglese
BORSE DI STUDIO
- Novembre 2013 – ad oggi
Borsa di studio per i Dottorandi finanziata dall’Universitą degli Studi di Pavia
Progetto di ricerca
Analisi della variabilitą genetica in popolazioni umane ed animali
La genetica evoluzionistica nell'Uomo e negli animali sta iniziando ad utilizzare approcci metodologici in grado di analizzare contemporaneamente numerosissimi marcatori genetici (a diversa tipologia di trasmissione) per individuo. Tuttavia, la maggior parte degli studi effettuati finora si sono generalmente concentrati su dataset contenenti solo pochi soggetti per ogni popolazione o specie. Il progetto di cui mi sto occupando ha lo scopo di utilizzare queste nuove metodiche su un gran numero di soggetti in modo da permettere analisi non solo in contesti macrogeografici, ma anche in contesti microgeografici.
Pubblicazioni
Olivieri A., Gandini F., Achilli A., Fichera A., Rizzi E., Bonfiglio S., Battaglia V., Brandini S., De Gaetano A., El-Beltagi A., Lancioni H., Agha S., Willerslev E., Semino O., Ferretti L., Torroni A. (2015)
Mitogenomes from Egyptian Cattle Breeds: New Clues on the Origin of Haplogroup Q and Early Spread of Bos taurus from the Near East. PLoS One 10: e0141170
- Abstract di congressi:
Achilli A., Perego U.A., Owings A., Lancioni O., Olivieri A., Cardinali I., Capodiferro M.R., Battaglia V., Brandini S., Fichera A., Woodward S.R., Semino O., Johnson J.R., Willerslev E., Stoneking M., Torroni A., Malhi R.S. (2015)
A comprehensive, diachronic and comparative picture of the mitogenome variation along the Americans
ASHG 2015
Olivieri A., Gandini F., Achilli A., Fichera A., Rizzi E., Bonfiglio S., Battaglia V., Brandini S., De Gaetano A., El-Beltagi A., Lancioni H., Agha S., Semino O., Ferretti L., Torroni A. (2015)
Mitogenomes from Egyptian cattle breeds: new clued on the origin of haplogroup Q and the early spread of Bos Taurus from the Near East
Join Meeting AGI-SIMA – Cortona (AR), Italy, 28-30 September 2015
Zanetta F., Pignataro D., Olivieri A., Brandini S., Cipponeri A.C., Torroni A., Biamonti G., Montecucco A. (2015)
A new mutation in mitochondrial DNA of a Parkinson’s patient in associated with signs of genomic DNA damage
The Biennial Congress of The Italian Association of Cell Biology and Differentiation - September 17-19th, 2015 Bologna
Zanetta F., Biamonti G., Olivieri A., Brandini S., Torroni A., Pignataro D., Montecucco A. (2015)
Signs of genomic DNA damage in mitochondrial complex I-mutated cytoplasmic hybrids cell lines from Parkinson's patients
VI Meeting on the Molecular Mechanism of Neurodegeneration Congress – May 28-30th, 2015 Milan
Gandini F., Achilli A., Pala M., Bodner M., Brandini S., Salas A., Scozzari R., Coppa A., Cruciani F., Parson W., Semino O., Richards M., Torroni A., Olivieri A. (2014)
Ancient human migrations form Arabia to Eastern Africa: new clues from R0a mitogenomes
FISV XIII Congress – FISV 2014, Pisa, Italy, 24-27 September 2014
Linguiti G.*, Brandini S., Grande F., Vaccarelli G., Zizzo N., Ciccarese S. (2013)
Genomic organization, expression and evolution of gamma and beta TCR genes in Tursiops truncatus.
10th International Veterinary Immunology Symposium - IVIS 2013, Milan, Italy
- Sequenze sottomesse:
EBI Accession Number: HG328286-HG328324
INFORMAZIONI PERSONALI
Cognome e nome: Brandini Stefania
Data e luogo di nascita: 11 maggio 1988, Bari (BA)
E mail: stefania.brandini01@universitadipavia.it
Skype: stefania.brandini1
ISTRUZIONE E FORMAZIONE
- Novembre 2013 ad oggi
Dottorato di ricerca in Genetica, Biologia Molecolare e Cellulare presso l’Universitą degli Studi di Pavia, Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “Lazzaro Spallanzani”, laboratorio di Genetica Umana, supervisore prof. A Torroni
- Ottobre 2010 - Marzo 2013
Laurea magistrale in Biologia Cellulare e Molecolare, indirizzo genomico con votazione 110/110 e lode presso Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”
Discussione della tesi sperimentale in Immunogenetica dal titolo “Organizzazine genomica, analisi di espressione ed evoluzione dei loci del T cell receptor gamma (TRG) e beta (TRB) in Tursiops truncatus”, relatori prof.sse R. Antonacci, S. Ciccarese
- Ottobre 2006 - Luglio 2010
Laurea triennale in Biologia Cellulare e Molecolare con votazione 106/110 presso Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”
Discussione della tesi sperimentale in Biologia Molecolare dal titolo “Studio dell’espressione dei geni DRD1, DRD2 e DARPP32 attraverso Real Time PCR”, relatore prof.ssa G. Gadaleta
- Settembre 2001 - Luglio 2006
Maturitą scientifica presso Liceo Scientifico “E. Fermi”, Bari
ESPERIENZA PROFESSIONALE
- Ottobre 2014 ad oggi
Tutor didattico nel corso di Genetica I, corso di laurea in Biologia, Universitą degli Studi di Pavia, supervisore prof.ssa O. Semino
- Settembre 2013 - Ottobre 2013
Insegnante al Corso di recupero “Statistica applicata alle biotecnologie, integrato con genetica”, Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”, Dipartimento di Bioscienze, Biotecnologie e Biofarmaceutica
- Aprile 2013 - Ottobre 2013
Tirocinio post-laurea presso il laboratorio di Immunogenetica, Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”, Dipartimento di Biologia, prof.ssa S. Ciccarese
- Marzo 2012 - Marzo 2013
Internato presso il laboratorio di Immunogenetca presso Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”, Dipartimento di Biologia, prof.sse R. Antonacci, S. Ciccarese
- Agosto 2011 - Marzo 2012
Attivitą volontaria presso il laboratorio di colture primarie e metastatizzazione, I.R.C.C.S. Ospedale Oncologico di Bari, Istututo Tumori “Giovanni Paolo II”, dott.ssa A. Bellizzi
- Gennaio 2010 - Marzo 2010
Tirocinio presso il laboratorio di Biologia Molecolare presso Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”, Dipartimento di Biologia, prof.ssa G. Gadaleta
QUALIFICHE PROFESSIONALI
- Settembre 2013
Abilitazione alla professione di biologo, presso Universitą degli Studi di Bari “Aldo Moro”
PARTECIPAZIONE A CORSI E CONVEGNI
- Settembre 2015
Joint Meeting AGI-SIMA, Cortona, 28-30 September 2015
- Settembre 2014
FISV XIII Congress – FISV 2014, Pisa, Italy, 24-27 September 2014
- Settembre 2014
CABGen Bioinformatics course
- Agosto 2013 - Settembre 2013
10th IVIS MILAN 2013 28th August- 1st September International Veterinary Immunology Symposium
- Ottobre 2010
Corso di formazione “Stato dell’arte e nuovi approcci biomolecolari in oncologia: dalla ricerca al laboratorio”, I.R.C.C.S. Ospedale Oncologico di Bari, Istituto Tumori “Giovanni Paolo II”
COMPETENZE TECNICHE
- Analisi di espressione genica mediante 3’RACE, 5’RACE, RT-PCR, Real Time PCR
- Estrazione di DNA ed RNA da sangue, tessuti e saliva
- Dosaggio genico
- Clonaggio mediante trasformazione per shock termico
- Estrazione e purificazione di DNA plasmidico
- Digestioni enzimatiche, RFLP
- PCR su DNA genomico e mitocondriale
- Preparazione di librerie NGS
- Analisi di sequenze ottenute tramite sequenziamento Sanger e Illumina
- Analisi filogenetiche
- Test di paternitą mediante analisi di microsatelliti
- Processazione di tessuti e colture primarie
- Immunofluorescenza
CONOSCENZE INFORMATICHE
- Ambiente Windows e OS X
- Banche dati biologiche (NCBI, Ensemble)
- Programmi per analisi di sequenza, costruzione di primer e di alberi filogenetici, analisi statistiche
LINGUE
- Madrelingua: Italiano
- Seconda lingua: Inglese
BORSE DI STUDIO
- Novembre 2013 – ad oggi
Borsa di studio per i Dottorandi finanziata dall’Universitą degli Studi di Pavia
Progetto di ricerca
Analisi della variabilitą genetica in popolazioni umane ed animali
La genetica evoluzionistica nell'Uomo e negli animali sta iniziando ad utilizzare approcci metodologici in grado di analizzare contemporaneamente numerosissimi marcatori genetici (a diversa tipologia di trasmissione) per individuo. Tuttavia, la maggior parte degli studi effettuati finora si sono generalmente concentrati su dataset contenenti solo pochi soggetti per ogni popolazione o specie. Il progetto di cui mi sto occupando ha lo scopo di utilizzare queste nuove metodiche su un gran numero di soggetti in modo da permettere analisi non solo in contesti macrogeografici, ma anche in contesti microgeografici.
Pubblicazioni
Olivieri A., Gandini F., Achilli A., Fichera A., Rizzi E., Bonfiglio S., Battaglia V., Brandini S., De Gaetano A., El-Beltagi A., Lancioni H., Agha S., Willerslev E., Semino O., Ferretti L., Torroni A. (2015)
Mitogenomes from Egyptian Cattle Breeds: New Clues on the Origin of Haplogroup Q and Early Spread of Bos taurus from the Near East. PLoS One 10: e0141170
- Abstract di congressi:
Achilli A., Perego U.A., Owings A., Lancioni O., Olivieri A., Cardinali I., Capodiferro M.R., Battaglia V., Brandini S., Fichera A., Woodward S.R., Semino O., Johnson J.R., Willerslev E., Stoneking M., Torroni A., Malhi R.S. (2015)
A comprehensive, diachronic and comparative picture of the mitogenome variation along the Americans
ASHG 2015
Olivieri A., Gandini F., Achilli A., Fichera A., Rizzi E., Bonfiglio S., Battaglia V., Brandini S., De Gaetano A., El-Beltagi A., Lancioni H., Agha S., Semino O., Ferretti L., Torroni A. (2015)
Mitogenomes from Egyptian cattle breeds: new clued on the origin of haplogroup Q and the early spread of Bos Taurus from the Near East
Join Meeting AGI-SIMA – Cortona (AR), Italy, 28-30 September 2015
Zanetta F., Pignataro D., Olivieri A., Brandini S., Cipponeri A.C., Torroni A., Biamonti G., Montecucco A. (2015)
A new mutation in mitochondrial DNA of a Parkinson’s patient in associated with signs of genomic DNA damage
The Biennial Congress of The Italian Association of Cell Biology and Differentiation - September 17-19th, 2015 Bologna
Zanetta F., Biamonti G., Olivieri A., Brandini S., Torroni A., Pignataro D., Montecucco A. (2015)
Signs of genomic DNA damage in mitochondrial complex I-mutated cytoplasmic hybrids cell lines from Parkinson's patients
VI Meeting on the Molecular Mechanism of Neurodegeneration Congress – May 28-30th, 2015 Milan
Gandini F., Achilli A., Pala M., Bodner M., Brandini S., Salas A., Scozzari R., Coppa A., Cruciani F., Parson W., Semino O., Richards M., Torroni A., Olivieri A. (2014)
Ancient human migrations form Arabia to Eastern Africa: new clues from R0a mitogenomes
FISV XIII Congress – FISV 2014, Pisa, Italy, 24-27 September 2014
Linguiti G.*, Brandini S., Grande F., Vaccarelli G., Zizzo N., Ciccarese S. (2013)
Genomic organization, expression and evolution of gamma and beta TCR genes in Tursiops truncatus.
10th International Veterinary Immunology Symposium - IVIS 2013, Milan, Italy
- Sequenze sottomesse:
EBI Accession Number: HG328286-HG328324
